1、两者的主要区别在于：所有权：国有资本由于是国家财政拨款，企业的所有权归国家，国家委派法定代表人管理企业。国有法人资本，基本实现了所有权和经营权的分离，企业有了更大的自主权。利润分配：国有资本，国家凭所有者的身份参加企业的生产经营活动和全部的利润分配。国有法人资本，国家凭借其所有权通过收取流转税和收益税的办法和企业分利。企业经营：国有资本，国家委派中央审计署直接审计财务的收支情况。国有法人资本，国家不参加企业具体的经营管理。

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